תרופות קונבנציונאליות רבות, להבדיל מהומאופתיה, אינן מתאימות לשימוש בהריון או עלולות לגרום לתופעות לוואי שליליות עבור העובר. שימוש במוצרים ותרופות הומואפתיות במהלך הריון הם פיתרון אידיאלי ובטוח.

יתרון נוסף לשימוש בהומאופתיה במהלך ההריון הוא התייחסותה למחלות ורגישויות העוברות בתורשה. כל אישה, למעשה, מאופיינת בנטיות העוברות בתורשה באמצעות גנים או טראומות שנרכשו במהלך חייה. התינוק יירש מכלול נטיות זה, שהוא לעתים שלילי, הן מאביו והן מאמו. לדוגמא, אם הסובלת מאקזמות ואב אסמטי יעבירו לתינוקם אחת מנטיות אלו, לעיתים אף את שתיהן גם יחד.

טיפול הומאופתי במהלך תשעת חודשי ההיריון יפחית, ואולי אף ימנע, את העברת הנטיות השליליות הללו על ידי ניקוז הרעלנים של ההורים והגדלת הפוטנציאל של העובר.